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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Acre. |
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Data corrente: |
18/11/2015 |
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Data da última atualização: |
16/11/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
OLIVEIRA, J. R. de; ANDRADE NETO, R. de C.; ALMEIDA, U. O. de. |
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Afiliação: |
João Ricardo de Oliveira; ROMEU DE CARVALHO ANDRADE NETO, CPAF-AC; Ueliton Oliveira de Almeida, Ufac. |
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Título: |
Época de plantio e sistemas de cultivo: influência sobre a acidez dos frutos de abacaxi. |
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Ano de publicação: |
2015 |
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Fonte/Imprenta: |
In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DA CULTURA DO ABACAXI, 6., 2015, Conceição do Araguaia. [Anais]. Belém, PA: SEDAP, 2015. |
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Páginas: |
4 p. |
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Descrição Física: |
1 CD-ROM |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
As mudanças geradas pela acidez titulável (AT) é de fundamental importância no desenvolvimento do sabor do fruto. Geralmente, vários ácidos orgânicos são responsáveis pelo sabor. O objetivo do trabalho foi avaliar efeito das épocas de plantio e dos sistemas de cultivo sobre a acidez do abacaxizeiro, cv. Rio Branco. A pesquisa foi realizada a partir de um ensaio de campo instalado e conduzido de junho de 2012 a janeiro de 2014. O experimento de campo foi implantado no delineamento em blocos casualizados completos com três repetições e os tratamentos distribuídos em esquema de parcelas subdivididas. As parcelas foram constituídas por quatro épocas de plantio, correspondentes aos meses de junho, julho, agosto e setembro e as subparcelas foram compostas por dois sistemas de cultivos, isto é, sistema irrigado e não irrigado, totalizando, desse modo, oito tratamentos. Em Laboratório, cinco frutos por tratamento foram processados em multiprocessador e coados para extração do suco, visando determinar a acidez titulável (AT) pelo método de titulação com NaOH 0,1 N. As médias dos dados foram comparadas pelo teste de Tukey a 5%. As épocas de plantio e os sistemas de cultivos influenciam a acidez do suco do abacaxizeiro, sendo as maiores médias apresentadas em plantios realizados nos meses de agosto, independente do sistema de cultivo, irrigado ou de sequeiro. |
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Palavras-Chave: |
Acidez do fruto; Acidez titulável (AT). |
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Thesagro: |
Abacaxi; Ananás Comosus; Época de Plantio; Fruticultura; Sistema de Cultivo. |
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Categoria do assunto: |
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/133363/1/25777.pdf
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Marc: |
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520 $aAs mudanças geradas pela acidez titulável (AT) é de fundamental importância no desenvolvimento do sabor do fruto. Geralmente, vários ácidos orgânicos são responsáveis pelo sabor. O objetivo do trabalho foi avaliar efeito das épocas de plantio e dos sistemas de cultivo sobre a acidez do abacaxizeiro, cv. Rio Branco. A pesquisa foi realizada a partir de um ensaio de campo instalado e conduzido de junho de 2012 a janeiro de 2014. O experimento de campo foi implantado no delineamento em blocos casualizados completos com três repetições e os tratamentos distribuídos em esquema de parcelas subdivididas. As parcelas foram constituídas por quatro épocas de plantio, correspondentes aos meses de junho, julho, agosto e setembro e as subparcelas foram compostas por dois sistemas de cultivos, isto é, sistema irrigado e não irrigado, totalizando, desse modo, oito tratamentos. Em Laboratório, cinco frutos por tratamento foram processados em multiprocessador e coados para extração do suco, visando determinar a acidez titulável (AT) pelo método de titulação com NaOH 0,1 N. As médias dos dados foram comparadas pelo teste de Tukey a 5%. As épocas de plantio e os sistemas de cultivos influenciam a acidez do suco do abacaxizeiro, sendo as maiores médias apresentadas em plantios realizados nos meses de agosto, independente do sistema de cultivo, irrigado ou de sequeiro.
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Registro original: |
Embrapa Acre (CPAF-AC) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Data corrente: |
13/12/2018 |
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Data da última atualização: |
23/06/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
PESSOA FILHO, M. A. C. de P.; SOUZA SOBRINHO, F. de; FRAGOSO, R. da R.; SILVA JUNIOR, O. B. da; FERREIRA, M. E. |
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Afiliação: |
MARCO AURELIO CALDAS DE PINHO PESSO, CPAC; FAUSTO DE SOUZA SOBRINHO, CNPGL; RODRIGO DA ROCHA FRAGOSO, CPAC; ORZENIL BONFIM DA SILVA JUNIOR, Cenargen; MARCIO ELIAS FERREIRA, SIRE. |
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Título: |
A draft genome assembly for the forage grass Urochloa ruziziensis based on single-molecule real-time sequencing. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
In: BRAZILIAN BIOTECHNOLOGY CONGRESS, 7.; BIOTECHNOLOGY IBERO-AMERICAN CONGRESS, 2., 2018, Brasília, DF. Proceedings... Brasília, DF: SBBiotec, 2018. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
ABSTRACT: Ruzigrass (Urochloa ruziziensis) is a diploid, tropical forage grass native to Africa, widely planted in Brazil, and known for its high nutritional quality. It is closely related to other important forage species of Urochloa, playing a crucial role in the breeding program of brachiaria grasses, which is mostly focused on inter-specific hybrids. Previous studies from our group based on shallow Illumina sequencing resulted in the development of the first molecular markers for the species, as well as in assessments of germplasm diversity and structure. Assembly and analysis of complete plastid genomes for four Urochloa species allowed the characterization of their phylogenetic divergence. Here, we strengthen the set of genomic tools for tropical forage grasses by assembling long reads into a first draft for the nuclear genome of the heterozygous clone C69. We used PacBio Sequel to generate over 13.3 million raw reads (mean size 6.5 kbp), adding up to 87.5 Gbp of raw data (~142x coverage). The current assembly using FALCON contains ~1.02 Gbp in 7,628 primary contigs, with NG50 of 412 kbp. It covers almost twice the size of the estimated haploid genome size of 615 Mbp for ruzigrass, indicating that haplotypes were assembled separately. In addition, RNA-seq data was obtained, totaling 258 million reads and 26 Gbp of raw data. These will allow transcriptome characterization for different tissues and aid gene prediction and annotation. Ongoing research includes haplotype phasing, polishing, assembly curation and Hi-C scaffolding. A high-quality genome assembly for ruzigrass will aid research groups in the development and application of genomic tools in breeding and genetics of brachiaria grasses. MenosABSTRACT: Ruzigrass (Urochloa ruziziensis) is a diploid, tropical forage grass native to Africa, widely planted in Brazil, and known for its high nutritional quality. It is closely related to other important forage species of Urochloa, playing a crucial role in the breeding program of brachiaria grasses, which is mostly focused on inter-specific hybrids. Previous studies from our group based on shallow Illumina sequencing resulted in the development of the first molecular markers for the species, as well as in assessments of germplasm diversity and structure. Assembly and analysis of complete plastid genomes for four Urochloa species allowed the characterization of their phylogenetic divergence. Here, we strengthen the set of genomic tools for tropical forage grasses by assembling long reads into a first draft for the nuclear genome of the heterozygous clone C69. We used PacBio Sequel to generate over 13.3 million raw reads (mean size 6.5 kbp), adding up to 87.5 Gbp of raw data (~142x coverage). The current assembly using FALCON contains ~1.02 Gbp in 7,628 primary contigs, with NG50 of 412 kbp. It covers almost twice the size of the estimated haploid genome size of 615 Mbp for ruzigrass, indicating that haplotypes were assembled separately. In addition, RNA-seq data was obtained, totaling 258 million reads and 26 Gbp of raw data. These will allow transcriptome characterization for different tissues and aid gene prediction and annotation. Ongoing research includes haplotype p... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Bioinformática; De novo Assembly; Montagem de sequência de DNA. |
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Thesagro: |
Brachiaria Ruziziensis; Genoma; Pastagem. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/186953/1/920-apagar.pdf
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Marc: |
LEADER 02571nam a2200229 a 4500
001 2101425
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100 1 $aPESSOA FILHO, M. A. C. de P.
245 $aA draft genome assembly for the forage grass Urochloa ruziziensis based on single-molecule real-time sequencing.$h[electronic resource]
260 $aIn: BRAZILIAN BIOTECHNOLOGY CONGRESS, 7.; BIOTECHNOLOGY IBERO-AMERICAN CONGRESS, 2., 2018, Brasília, DF. Proceedings... Brasília, DF: SBBiotec$c2018
520 $aABSTRACT: Ruzigrass (Urochloa ruziziensis) is a diploid, tropical forage grass native to Africa, widely planted in Brazil, and known for its high nutritional quality. It is closely related to other important forage species of Urochloa, playing a crucial role in the breeding program of brachiaria grasses, which is mostly focused on inter-specific hybrids. Previous studies from our group based on shallow Illumina sequencing resulted in the development of the first molecular markers for the species, as well as in assessments of germplasm diversity and structure. Assembly and analysis of complete plastid genomes for four Urochloa species allowed the characterization of their phylogenetic divergence. Here, we strengthen the set of genomic tools for tropical forage grasses by assembling long reads into a first draft for the nuclear genome of the heterozygous clone C69. We used PacBio Sequel to generate over 13.3 million raw reads (mean size 6.5 kbp), adding up to 87.5 Gbp of raw data (~142x coverage). The current assembly using FALCON contains ~1.02 Gbp in 7,628 primary contigs, with NG50 of 412 kbp. It covers almost twice the size of the estimated haploid genome size of 615 Mbp for ruzigrass, indicating that haplotypes were assembled separately. In addition, RNA-seq data was obtained, totaling 258 million reads and 26 Gbp of raw data. These will allow transcriptome characterization for different tissues and aid gene prediction and annotation. Ongoing research includes haplotype phasing, polishing, assembly curation and Hi-C scaffolding. A high-quality genome assembly for ruzigrass will aid research groups in the development and application of genomic tools in breeding and genetics of brachiaria grasses.
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653 $aDe novo Assembly
653 $aMontagem de sequência de DNA
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700 1 $aFRAGOSO, R. da R.
700 1 $aSILVA JUNIOR, O. B. da
700 1 $aFERREIRA, M. E.
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Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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